LBBM

Laboratoire Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes (LBBM), UMR 8176 SU-UPVD-CNRS

Le Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes (UMR8176 - LBBM), est une unité mixte de service et de recherche de Sorbonne Université, de l'Université Perpignan Via Domitia  et du CNRS fondée en 2014 avec pour mission de faire progresser les frontières de la recherche scientifique en microbiologie et (bio)chimie environnementale, tout en répondant aux grands défis sociétaux en matière de santé humaine et environnementale.

Ses membres conduisent une recherche interdisciplinaire, autour de 3 axes prioritaires : BIM (Bases fondamentales et appliquées des Interactions Microbiennes), E2 (Environnement x Ecotoxicologie) et GENOPHY (Genomique Evolutive et Environnementale du Phytoplancton).

 

Directeur

  • Directeur Unité : Didier Stien
  • Directrice adjointe, référente UPVD : Lise Barthelmebs
  • Directeur adjoint :  Raphaël Lamy
     


Axes de recherche


Les personnels LBBM localisés à l’Université Perpignan Via Domitia sont impliqués dans les travaux de recherche des axes BIM et E2.

Au sein de l’axe BIM, nous explorons, d’une part, la diversité des micro-organismes et les mécanismes responsables de la structuration de cette diversité, et d’autre part, le rôle des communautés microbiennes dans le fonctionnement de systèmes plus complexes, principalement dans les sols, les sédiments et les eaux douces anthropisées.

Au sein de l’axe E2, nous développons une recherche visant à étudier le devenir des contaminants chimiques et biologiques dans les écosystèmes aquatiques et terrestres, et à caractériser les impacts des contaminants, à évaluer leurs effets sur des organismes aquatiques, terrestres et sur les communautés microbiennes naturelles en déployant des approches biocapteurs et omiques.
 


Équipements

Chimie Analytique
  • HPLC / UV avec passeur d’échantillons (VWR-Hitachi)
  • HPLC /UV Shimadzu
  • HPLC / UV / Fluorescence (Merck-Hitachi)
  • Spectrophotomètre UV-visible (HP 8452A)
  • Spectrophotomètre UV-visible thermostaté (Shimadzu UV-1800)
  • Spectrofluorimètre (Safas)
  • Rotavapor R100 avec pompe de refroidissement (Buchi )
     
Biochimie/Biologie Moléculaire/Microbiologie
  • Lecteur de microplaques UV-vis (Epoch 2_BioTeK)
  • Lecteur de microplaques Fluorescence/Luminescence (Thermo Scientific Fluoroskan Ascent FL)
  • Postes de sécurité microbiologique (Esco)
  • Thermocycleur (Eppendorf Thermomixer comfort)
  • Centrifugeuse réfrigérée (Hettisch)
  • Homogénéisateur (Mikro-Dismembranor S Sartorius)
  • Etuves, table agitante thermostatée (Memmert, Stuart)
  • Matériel d’électrophorèse ADN et protéines (Biorad)
  • Microscope (Leica DM750)
     
Capteurs / Biocapteurs
  • Station électrochimique multivoies Autolab PGSTAT M204 (4 voies dont FRA et BA)
  • Station de spectroélectrochimie composé d’un potenstiostat Autolab PGSTAT 101 et d’un module/cellule spectrophotométrique (TSC Spectro cell 840,216_Methrom)
  • 2 Potentiostats Biologics SP150
  • 1 Potenstiost muntichannel STAT8000P (Dropsens-Metrohm)
  • 4 Potentiostats (Ampéromètres) Metrohm 641VA avec enregistreur
  • 3 Potentiostats de terrain (2 Uniscan ET & AUTOLAB µstat 400)
  • Lecteur de microplaque électrochimique (Dropsens)
  • Machine à sérigraphier DEK 248 (fabrication électrodes)
  • 2 Imprimantes 3D
  • Microbalance à cristal de quartz
  • Goniomètre (Digidrop_GBX scientific ltd)
     


Projets de recherche

  • Programme ANR SENTINEL 2020-2024, (Gaelle Catanante) « Des outils de screening haut-débit pour une surveillance renforcée de la sécurité chimique des aliments ».
    Programme Interreg POCTEFA TESTACOS+  2024-2027, (G. Istamboulié, T. Noguer, Ch. Canal) "Solutions innovantes pour améliorer la sécurité alimentaire des fromages affinés produits et commercialisés dans la zone transfrontalière Espagne-France".(projet n°EFA042/01) https://www.testacosplus.eu
    Programme Interreg SUDOE “Aquacare"  2025 -2028 : (T. Noguer, C. Blanchard, G. Istamboulie) "Identification, quantification et élimination des polluants émergents des bassins hydrographiques”  (projet n° S2/2.5/E0223)
    Projet Fédération de Recherche Energie et Environnement (FREE 2043) 2025 (Florence Vouve (LBBM) et Marie-Virginie Salvia (CRIOBE)) "Caractérisation des fractions des matières organiques de sol par approche couplée en fluorescence et métabolomique (FLUOMOMIC)".
    Projet  Fondation UPVD  2025-26.  (Florence Vouve (LBBM) et Dominique Aubert (CEFREM)) : "Contribution à la connaissance du réseau KARstique du plateau de SAUlt par couplage de traçages FLUOrescents artificiels et naturels avec la composition Métallique dans les Eaux (KARSAUFLUOME)."
    Projet BQR UPVD 2024-2026. (Lise Barthelmebs et Georges Istamboulie). READ, Réutilisation des Eaux usées traitées et Antibiorésitance-Antibiotiques Détection.
     
 

Contacts

LBBM, Bat S et B, UPVD, 52 avenue Paul-Alduy 66860 Perpignan cedex 9

Mise à jour le 10 juillet 2025
https://www.univ-perp.fr/recherche/structures-de-recherche/lbbm